Biologisk nedbrytning av plast med marine bakterier: hva vitenskapen allerede vet og hvordan man bruker det

  • Marine bakterier forbruker forbindelser som lekkes ut fra plast og reduserer noe av deres kjemiske pÃ¥virkning.
  • M5-motivet identifiserer funksjonelle PETaser i havet og veileder enzymdesign for PET-resirkulering.
  • PLA brytes ikke raskt ned i havet; gammel plast frigjør flere forbindelser enn ny plast.
  • Ansvarlig bruk innebærer enzymer i renseanlegg, ikke utslipp av mikrober i havet.

biologisk nedbrytning av plast med marine bakterier

Den massive tilstedeværelsen av plast i havet, en form for Marin forurensningProblemet er ikke lenger begrenset til det vi ser med det blotte øye: i tillegg til garn, emballasje og mikroplast, får havet et konstant regn av kjemiske forbindelser som plasten selv frigjør over tid. Disse forbindelsene, kjent som sigevann, kan være giftige, og likevel har visse marine bakterier begynt å bruke dem som mat. Dette økologiske skiftet åpner et reelt vindu for bioremedieringTiden renner imidlertid ut på grunn av mengden avfall som når vannet hvert år.

I mellomtiden utvikler en annen vitenskapelig front seg raskt: identifiseringen av marine enzymer som er i stand til å kutte polymerer som PET som brukes i flasker og tekstiler. Et sentralt strukturelt motiv, kalt M5, lar forskere skille hvilke hav-PETaser som virkelig er funksjonelle og hvilke som bare er imitasjoner. Denne kombinasjonen av funn – bakterier som forbruker sigevann og enzymer som angriper polymerer – antyder komplementære veier. for å redusere virkningen av plastforurensning, fra Middelhavet til de dypeste havdyp.

Plastforurensning i havet: kontekst og hastverk

plastforurensning i havet

I Middelhavet har tettheten av plastfragmenter nådd alarmerende nivåer, med et berørt område tilsvarende omtrent 7.500 fotballbaner. Utover den visuelle påvirkningen, Det alvorlige problemet er blandingen av typer vannforurensningfordi gjenstandene frigjør tilsetningsstoffer og nedbrytningsprodukter som løses opp i vann.

Denne prosessen med å frigjøre forbindelser kalles utvasking. Når plast kommer i kontakt med sjøvann, frigjøres molekyler, noen med skadelige effekter på marint liv. Sollys akselererer prosessen. Plast som flyter på overflaten lekker ut mer enn de som forblir under vann.Så søppel-"øyene" er ikke bare et fysisk problem, men også et kjemisk et.

Det globale omfanget av problemet, anslått til mellom 8 og 12 millioner tonn som dumpes årlig, overstiger langt den naturlige kapasiteten for assimilering og er en del av truslene som tynger havet. Havet er ikke i nærheten av å «rense seg selv» med dagens tempo.Derfor søken etter komplementære biologiske og industrielle løsninger.

I dette scenariet fremstår naturlige bioremedieringsstrategier – som utnytter aktiviteten til mikroorganismer – som en lovende vei, forutsatt at begrensningene deres er godt forstått. Målet er ikke å slippe ut mikrober i havet uten kontroll.men heller å identifisere prosesser og verktøy som kan brukes klokt.

Faktisk inkluderer hele bildet både selve polymeren og biproduktene den frigjør. Vitenskapen begynner å skille mellom bakterier som «spiser» selve plasten og bakterier som metaboliserer forbindelsene plasten frigjør. Dette skillet er avgjørende for å utforme effektive tiltak og måle risikoer.

Marine bakterier som utnytter plastsigkevann

marine bakterier sigevann fra plast

Et team fra Institute of Marine Sciences (ICM-CSIC) har identifisert bakteriegrupper som forbruker kjemiske forbindelser som frigjøres under nedbrytningen av plast i saltvann. I motsetning til mange tidligere studier som har fokusert på direkte «biting» av polymeren, Denne studien fokuserer på sigevann som en kilde til karbon for mikrobiell vekst.

Til eksperimentene sine brukte de polyetylen – den mest forekommende plasten i havet – og en blanding av aldret materiale samlet på stranden som inneholdt polyetylen og polypropylen. De brukte teknikker som CARD-FISH (for å finne dominante grupper), BONCAT (vekstaktivitet) og 16S rRNA-gensekvensering (taksonomisk sammensetning), Det ble funnet at kjente marine bakterier kan omdanne disse forbindelsene til CO2, biomasse og andre biprodukter..

Det interessante er at dette er arter som er beskrevet i litteraturen, men som ikke tidligere er assosiert med eliminering av plastderivater. Denne «nye evnen» åpner døren for bioteknologiske anvendelser for å redusere den kjemiske påvirkningen. spesielt i områder der solstråling forsterker utvasking.

Funnet gjør ikke sigevannet ufarlig over natten, men det antyder at noe av det oppløste organiske materialet kan behandles av mikrobiell biocenose av havet. Det er en delvis lettelse, ikke en komplett livline.fordi mengden avfall som tilføres er enorm.

Fremover planlegger teamet å isolere og dyrke noen av de mest lovende bakteriene for målrettet testing. Målet er todelt: å forstå mekanismene som er involvert og å vurdere deres potensielle oversettelse til kontrollerte systemer. Hvis visse slektslinjer kan dyrkes med stabilitetDet ville være mulig å evaluere konsortier som samarbeider om ulike forbindelser.

PETase-enzymer med M5-motiv: den funksjonelle signaturen for PET-nedbrytning

I mellomtiden har et internasjonalt konsortium ledet av KAUST funnet et nøkkelelement for å skille funksjonelle PETaser fra ikke-funksjonelle: M5-motivet. Etter å ha analysert mer enn 400 prøver fra de syv hav, inneholdt nesten 80 % bakterier med enzymatiske versjoner som bar dette motivet. M5-signalet fungerer som en strukturell markør som forutser reell aktivitet sammenlignet med PET.

Hemmeligheten ligger i den tredimensjonale konfigurasjonen. PETaser med M5 gjenkjenner og kløyver kjedene i polyetylentereftalatpolymeren, og fragmenterer den til produkter som andre mikrober kan utnytte. Lignende varianter uten denne egenskapen – noen ganger kalt pseudo-PETaser – mangler den nødvendige katalysen eller viser aktivitet på andre substrater. Forskjellen er ikke kosmetisk; den er funksjonell..

For å skille klinten fra hveten kombinerte teamet AI-drevet strukturell modellering med genetisk screening og laboratorievalidering. Bare de M5-forsterkede enzymene oppnådde målbar PET-nedbrytning under kontrollerte forhold, med effektivitet som i noen tilfeller nådde mellom 25 % og 50 % sammenlignet med den opprinnelige PETasen beskrevet i 2016. Den ytelsen, om enn beskjeden, er reproduserbar og fungerer som en mal for proteinteknikk.

Metagenomisk analyse indikerte at en stor andel av funksjonelle marine PETaser er kodet av bakterier av ordenen Pseudomonadales, kjent for sin allsidighet. Evolusjonen peker på en overgang fra enzymer som bryter ned naturlige hydrokarboner til syntetiske polymerer. Selektivt press fra menneskelig forurensning setter sitt preg på det mikrobielle genometogså i dypt, karbonfattig vann.

Moralen i historien er ikke at havet alene skal ta seg av PET, men at det finnes et globalt nettverk av «resirkulører» som vi kan inspirere og styrke utenfor havet. M5-motivet gir en molekylær blåkopi for å designe mer stabile og raskere versjoner, rettet mot lukket sløyfe, i renseanlegg eller til og med i godt utformede husholdningsapplikasjoner.

Andre nedbrytende mikrober: fra polyuretan til PHB

Den mikrobielle kapasiteten til å angripe plast er ikke begrenset til PET. I Japan ble en bakterie, Ideonella sakaiensis, beskrevet som i stand til å omdanne PET til PHB, en svært biologisk nedbrytbar polymer, noe som tyder på veier for bioplast og innovasjon med merverdi. Ideen om å omdanne avfall til nyttige materialer er ikke science fictionselv om det fortsatt er en vei å gå for å klatre den.

I Tyskland ble Pseudomonas sp. TDA1 isolert, som er i stand til å bryte ned grunnleggende komponenter i polyuretan, en allestedsnærværende plast i isolasjon, fottøy eller møbler, men vanskelig å resirkulere på grunn av sin termoherdende natur. Bryter polyuretanbindinger og utnytter dem som karbon, nitrogen og energi Det demonstrerer en metabolsk allsidighet som fortjener å bli utforsket i industrielle prosesser.

Jordsoppen Aspergillus tubingensis har også blitt rapportert å erodere overflaten av polyuretan ved hjelp av enzymer, og etterlate synlige arr i laboratoriet. I marine miljøer har man også oppdaget sopp som kan angripe polypropylen, og bakterieslekter som Pseudomonas og Lysinibacillus viser aktivitet mot HDPE og PET. Repertoaret av «biologiske verktøy» utvides til å omfatte flere vanlige polymerer.

Men vær obs på fristelsen til å tenke på mirakelløsninger. Bruk av bakterier eller sopp i stor skala innebærer å dyrke dem i enorme konsentrasjoner, kontrollere atferden deres og sørge for at de ikke forstyrrer lokale økosystemer. Ikke alle mikroorganismer er dyrkbare eller forutsigbare.og den vilkårlige bruken av den til sjøs er ikke et ansvarlig alternativ.

Derfor blir strategien med å jobbe med isolerte enzymer stadig mer populær. I motsetning til levende organismer er enzymer molekyler som kan doseres presist, produseres lokalt og spesialdesignes. Å ta det beste fra naturen og sette det inn i kontrollerte prosesser er den mest fornuftige tilnærmingen. for industrielle og resirkuleringsapplikasjoner.

Og hva med «biologisk nedbrytbart» PLA i havet?

En fersk studie ledet av ICM-CSIC avkrefter en utbredt idé: PLA, en plast av biologisk opprinnelse klassifisert som biologisk nedbrytbar, brytes ikke ned raskere i det marine miljøet enn materialer som polystyren, polyetylen eller polypropylen. PLA trenger temperaturer over 60 °C for å brytes ned effektivtforhold som ikke eksisterer i havet er ikke det samme som å satse på en ny plast som løses opp i havet.

I tester som eksponerte forskjellige typer plast for temperaturer og stråling som ligner på de som finnes i havet, ble det løste organiske karbonet de frigjorde og marine bakteriers evne til å bearbeide det målt. Resultat: PLA frigjør ikke mer karbon enn petroleumsbasert plast.og det resulterende organiske materialet brytes ikke ned bedre enn det fra for eksempel polystyren.

Videre frigjør gammel plast langt flere forbindelser enn ny plast fordi den mister beskyttende tilsetningsstoffer mot lys og erosjon. Anslag tyder på at kassert plast frigjør omtrent 57 000 tonn oppløst organisk karbon i havet årlig, mer enn det dobbelte av mengden som beregnes når man studerer nyproduserte fragmenter. Det hoppet i usynlige utslipp er alt annet enn anekdotisk..

Det positive aspektet er at marine bakterier er i stand til å utnytte en brøkdel av disse utvaskede forbindelsene, noe som reduserer noe av påvirkningen. Likevel gjenstår en annen brøkdel som motstår nedbrytning og kan akkumuleres. Håndtering av «biologisk nedbrytbar» plast krever semantisk og teknisk presisjonBiologisk nedbrytbar betyr ikke «den brytes ned hvor som helst».

Kort sagt, det å erstatte én polymer med en annen uten å evaluere dens faktiske ytelse i det marine miljøet kan føre til feilaktige løsninger. Etiketten for biologisk nedbrytbarhet må ledsages av plausible scenarioer for slutten av levetiden.Og havet er ikke for PLA.

Utfordringer, begrensninger og måter å søke på

Naturlig nedbrytning av mikrober er altfor sakte til å holde tritt med den årlige økningen av avfall. Å slippe ut plast og forvente at mikrober skal gjøre jobben er ikke bare ineffektivt, men også farlig for miljøet. Trofiske kjeder og biologisk mangfold. Tilnærmingen må være omfattende: forebygging, teknologi og god ledelse..

Det er ingen enkel oppgave å gjenskape det som fungerer i laboratoriet i industrien. Miljøvariabilitet kompliserer prosessen, og det oppstår spørsmål om utilsiktede økologiske påvirkninger, som potensielle genetiske overføringer. Miljøsikkerhet må komme foran bioteknologisk entusiasme.Uansett hvor fristende det kan være å fremskynde prosesser.

Fra et logistikk- og industriperspektiv er den fornuftige tilnærmingen å samle inn plast og behandle den i spesialiserte anlegg ved hjelp av enzymer eller kontrollerte mikrobielle konsortier. For at dette skal fungere, må prosessen lukkes med effektive innsamlingssystemer, polymerseparasjon og kostnadseffektiv skalerbarhet. Uten en godt kanalisert tilførsel av råvarer går «biofabrikkene» tomme for mat..

Fiskeri- og akvakultursektoren er sentrale interessenter. Det er anslått at rundt 20 % av plasten i havet kommer fra marine kilder (fiskeutstyr, konstruksjoner, transport), og veksten innen akvakultur peker mot en økning i problemet hvis det ikke iverksettes tiltak. Det finnes strender der mer enn 90 % av plastavfallet er fiskeavfall; på andre når det ikke engang 10 %.Dette understreker behovet for lokale diagnoser.

Løsninger involverer flere lag: redusere bruken av gjenstander som er utsatt for tap, velge biologisk nedbrytbare verktøy der det er fornuftig, og etablere insentiver for adopsjon. Det er også nødvendig å forbedre overvåkingen av marint avfall.med ROV-er og vitenskapelig dykking, vel vitende om at hver metode har sine begrensninger for å vurdere storskala påvirkninger.

Det finnes også praktiske ressurser, som verktøykasser med hundrevis av ideer for forebygging, overvåking og fjerning, sammen med anbefalinger for offentlig politikk for spesifikke regioner. Samordning mellom myndigheter, industri og vitenskap er det som forvandler isolerte ideer til reell endring.med klare mål og målinger.

Mekanismer, teknikker og fremtidige forskningslinjer

Å forstå hvem som gjør hva i havet krever å kombinere komplementære teknikker. CARD-FISH muliggjør lokalisering av dominerende bakteriegrupper in situ; BONCAT oppdager aktivt voksende celler; og 16S rRNA-sekvensering avslører samfunnssammensetningen. Disse verktøyene tegner sammen det funksjonelle kartet over marine mikrobiomer forbundet med plast og sigevann.

Metagenomikk og strukturell modellering av kunstig intelligens har vært nøkkelen til å skille aktive PETaser fra pseudo-PETaser. Ved å bruke M5-motivet som en veiledning, Proteinteknikk kan iterere design som får økt stabilitet, spesifisitet og hastighet.akselerererer en nedbrytning som i naturen skjer i sneglefart.

Parallelt bidrar «omikk»-tilnærminger – genomikk, proteomikk og metabolomikk – til å spore metabolske veier og sluttprodukter når bakterier bearbeider plasttilsetningsstoffer og derivater. Dette er viktig for å unngå overraskelser. En nyttig nedbrytningsprosess bør ikke generere flere problematiske forbindelser. som den har til hensikt å løse.

En annen lovende tilnærming innebærer å kombinere mikrober med komplementære funksjoner, organisert i konsortier. I teorien bryter noen innledende bindinger, andre forbruker mellomprodukter, og atter andre gjør opp for mer resistente forbindelser. Synergi kan forkorte nedbrytningstidenforutsatt at konsortiet er stabilt og sikkert utenfor laboratoriet.

Til slutt krever overføring av disse mulighetene til industrien at man vurderer skalerbarhet, kostnader og kompatibilitet med eksisterende resirkuleringsstrømmer. Plast som HDPE, PP og PET oppfører seg ikke på samme måte, og blandingene av disse kompliserer katalyseprosessen. Identifiser realistiske mulighetsvinduer – etter polymer og etter anvendelse – Det er like viktig som å designe det perfekte enzymet.

Bildet som tegner seg er tydelig: i havet sameksisterer to komplementære biologiske veier i kampen mot plast. På den ene siden bakterier som fortærer forbindelsene som frigjøres fra materialet, og delvis lindrer den usynlige kjemiske belastningen; på den andre siden spesialiserte enzymer, som M5-motiv PETaser, som er i stand til å bryte ned polymerer som PET. Utfordringen ligger i å utnytte denne kunnskapen på land, med innsamlingssystemer, kontrollerte enzymatiske prosesser og retningslinjer som hindrer avfall i å komme inn.Fordi det ikke er et fornuftig alternativ å vente på at havet skal gjøre jobben.

biologisk nedbrytbar plast fra alger
Relatert artikkel:
Innovasjon innen biologisk nedbrytbar plast fra alger